MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree plasmid pCLK

Total Repeats: 1694

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010418	CTT	2	6	17	22	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010418	CTT	2	6	76	81	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010418	TTTA	2	8	117	124	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010418	ATTA	2	8	125	132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010418	A	7	7	146	152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010418	CTT	2	6	2572	2577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010418	TTAT	2	8	2595	2602	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010418	A	7	7	2614	2620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010418	CCT	2	6	4654	4659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_010418	TTGT	2	8	4677	4684	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010418	ATTTA	2	10	4691	4700	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010418	CAT	2	6	5204	5209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010418	TAT	2	6	5819	5824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010418	T	6	6	5828	5833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010418	AAT	2	6	5834	5839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010418	TAAAAT	2	12	5854	5865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010418	AT	3	6	5867	5872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010418	TAA	2	6	5920	5925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010418	A	6	6	5937	5942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010418	TA	3	6	7034	7039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010418	TTA	2	6	7061	7066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010418	CCT	2	6	7981	7986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_010418	ATT	2	6	8006	8011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010418	TTA	2	6	8017	8022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010418	ATT	3	9	8024	8032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010418	A	7	7	8037	8043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010418	TAT	2	6	8066	8071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010418	A	8	8	8094	8101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010418	A	6	6	8106	8111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010418	TCC	2	6	9852	9857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_010418	TTA	2	6	9867	9872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010418	ATA	2	6	9873	9878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010418	AT	3	6	9880	9885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010418	T	6	6	9921	9926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010418	GTA	2	6	9983	9988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010418	ATT	2	6	9989	9994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010418	CTT	2	6	9998	10003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010418	TAA	2	6	10250	10255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010418	TAG	2	6	10269	10274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010418	T	6	6	10280	10285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010418	ACT	2	6	10289	10294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010418	TCC	2	6	10659	10664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_010418	AAT	2	6	10680	10685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010418	CCT	2	6	11001	11006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_010418	CTT	2	6	11477	11482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010418	TAA	2	6	11490	11495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010418	TCC	2	6	12487	12492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_010418	TAT	2	6	12523	12528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010418	TATT	2	8	12534	12541	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010418	A	6	6	12554	12559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010418	TA	4	8	12590	12597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010418	TA	3	6	12612	12617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010418	A	7	7	13105	13111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010418	GTA	2	6	13118	13123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010418	ATA	2	6	13127	13132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010418	AT	3	6	13136	13141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010418	AAAG	2	8	13149	13156	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010418	ATT	2	6	13192	13197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010418	T	7	7	13196	13202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010418	AT	3	6	13528	13533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010418	AT	3	6	13543	13548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010418	A	6	6	13565	13570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010418	ATT	2	6	13575	13580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010418	AAT	2	6	13594	13599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010418	ATT	2	6	13613	13618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010418	ATT	2	6	18196	18201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010418	T	6	6	18200	18205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010418	AT	3	6	18206	18211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010418	AAT	2	6	18225	18230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010418	A	6	6	18234	18239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010418	TAA	2	6	18240	18245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010418	A	6	6	18255	18260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010418	TTAC	2	8	18262	18269	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_010418	TA	3	6	18274	18279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010418	ATT	2	6	20793	20798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010418	GCG	2	6	21115	21120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_010418	GTCA	2	8	21149	21156	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_010418	ATC	2	6	21200	21205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010418	AT	3	6	21410	21415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010418	TCC	2	6	23974	23979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_010418	ATA	2	6	24008	24013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010418	ATTA	2	8	24014	24021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010418	ATT	3	9	24026	24034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010418	TCC	2	6	24422	24427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_010418	T	6	6	24431	24436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010418	TTA	2	6	24851	24856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010418	TAAT	2	8	24860	24867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010418	TAT	2	6	24868	24873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010418	A	7	7	24881	24887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010418	AAT	2	6	24918	24923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010418	TTA	2	6	24925	24930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010418	GCT	2	6	24971	24976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_010418	TTA	2	6	24985	24990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010418	TAA	2	6	25003	25008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010418	ATTA	2	8	25019	25026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010418	TTA	2	6	26514	26519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010418	TGT	2	6	26524	26529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010418	TA	3	6	26574	26579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010418	AT	3	6	26615	26620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010418	CCT	2	6	26785	26790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_010418	TCC	2	6	27183	27188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_010418	TAT	2	6	27215	27220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010418	TAAT	2	8	27222	27229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010418	TAT	2	6	27230	27235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010418	TTA	2	6	27284	27289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010418	AT	3	6	27323	27328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010418	CAT	2	6	27334	27339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_010418	ATT	2	6	27344	27349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010418	TTAC	2	8	27382	27389	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_010418	TTTA	2	8	27410	27417	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010418	TCC	2	6	27698	27703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_010418	TTA	2	6	27721	27726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010418	ACT	2	6	27781	27786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010418	T	7	7	27786	27792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010418	TA	4	8	27802	27809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010418	AGA	2	6	27810	27815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010418	TGC	2	6	27865	27870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_010418	AAT	2	6	27874	27879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010418	GTA	2	6	27950	27955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010418	TA	3	6	27958	27963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010418	TCC	2	6	27977	27982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_010418	TAAT	2	8	27986	27993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010418	TTTA	2	8	28023	28030	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010418	TTA	2	6	28058	28063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010418	AT	3	6	28075	28080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010418	GAA	2	6	28983	28988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010418	AAT	2	6	29006	29011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010418	GCT	2	6	29025	29030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_010418	ATTC	2	8	29058	29065	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_010418	AGT	2	6	29083	29088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010418	T	7	7	29109	29115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010418	TA	3	6	29135	29140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010418	TAA	2	6	29164	29169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010418	A	6	6	29168	29173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010418	TCCC	2	8	29402	29409	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
136	NC_010418	TCT	2	6	29442	29447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_010418	TA	3	6	29459	29464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010418	TCT	2	6	29476	29481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_010418	TAT	2	6	29518	29523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010418	CTA	2	6	29526	29531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_010418	CTT	2	6	29608	29613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_010418	AT	3	6	29674	29679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010418	TATCT	2	10	29702	29711	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_010418	ATG	2	6	30217	30222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010418	TCC	2	6	31260	31265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_010418	C	7	7	31511	31517	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
147	NC_010418	AAT	2	6	31530	31535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010418	ATT	3	9	31581	31589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010418	T	6	6	32678	32683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_010418	ATTA	3	12	32684	32695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_010418	T	7	7	32713	32719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_010418	TAA	2	6	32728	32733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_010418	ACC	2	6	32949	32954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
155	NC_010418	TAA	2	6	33019	33024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_010418	A	7	7	33116	33122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_010418	T	6	6	39274	39279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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242	NC_010418	A	7	7	47702	47708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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447	NC_010418	TA	3	6	82505	82510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
448	NC_010418	TAA	2	6	82529	82534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NC_010418	TA	3	6	82560	82565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NC_010418	AT	3	6	82575	82580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_010418	CTC	2	6	82587	82592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
452	NC_010418	CAAA	2	8	82600	82607	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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462	NC_010418	CCT	2	6	84203	84208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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487	NC_010418	ATT	2	6	86363	86368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
488	NC_010418	TA	3	6	86399	86404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
489	NC_010418	AT	3	6	86487	86492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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491	NC_010418	ATTT	2	8	86560	86567	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
492	NC_010418	T	6	6	86574	86579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
493	NC_010418	ATT	3	9	86661	86669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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498	NC_010418	CAT	2	6	87513	87518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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